Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc183A2AJB1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms