Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm12A2AJ77 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms