Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbbp8nlA2ABX0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms