Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms