Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trav12-2A0N8N6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trav12-2A0N8N6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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