Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc173A0JLY1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms