Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms