Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3550W4VSN7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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