Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd1Q9Z2E2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms