Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cib1Q9Z0F4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cib1Q9Z0F4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cib1Q9Z0F4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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