Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Carm1Q9WVG6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms