Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clcn5Q9WVD4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms