Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkraQ9WTX2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkraQ9WTX2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms