Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdh13Q9WTR5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh13Q9WTR5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh13Q9WTR5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh13Q9WTR5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh13Q9WTR5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh13Q9WTR5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh13Q9WTR5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdh13Q9WTR5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms