Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NbnQ9R207 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NbnQ9R207 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms