Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept6Q9R1T4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sept6Q9R1T4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms