Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn7Q9R1S8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms