Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubd1Q9R1K7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms