Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms