Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms