Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms