Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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