Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PnckQ9QYK9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PnckQ9QYK9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms