Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tomm40Q9QYA2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tomm40Q9QYA2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tomm40Q9QYA2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms