Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms