Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyhr1Q9QXA1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyhr1Q9QXA1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyhr1Q9QXA1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyhr1Q9QXA1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyhr1Q9QXA1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms