Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms