Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AatfQ9JKX4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms