Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scamp4Q9JKV5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms