Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Cnga3Q9JJZ8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cnga3Q9JJZ8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cnga3Q9JJZ8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cnga3Q9JJZ8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cnga3Q9JJZ8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cnga3Q9JJZ8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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