Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng4Q9JJV4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng4Q9JJV4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng4Q9JJV4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng4Q9JJV4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng4Q9JJV4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng4Q9JJV4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng4Q9JJV4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cacng4Q9JJV4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng4Q9JJV4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms