Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms