Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MesdQ9ERE7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MesdQ9ERE7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms