Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubb3Q9ERD7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms