Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ift43Q9DA69 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms