Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms