Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc103Q9D9P2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc103Q9D9P2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms