Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms