Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SlirpQ9D8T7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms