Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gtf3c6Q9D8P7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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