Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl4Q9D8E6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.1 ms