Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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