Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsf13Q9D777 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms