Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms