Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sec23bQ9D662 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23bQ9D662 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23bQ9D662 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23bQ9D662 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23bQ9D662 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23bQ9D662 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23bQ9D662 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sec23bQ9D662 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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