Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930449I24RikQ9D5E3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms