Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms