Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930564D02RikQ9D4S4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms