Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sohlh2Q9D489 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms