Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stag1Q9D3E6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms